Desde aquí tendrá la opción de eliminar un paquete, es importante que tenga en cuenta que si el paquete esta siendo usado por alguno de los dominios no te va a dejar eliminarlo:

1.Ingrese al WHM/cPanel

2.Ubique la opción Eliminar un paquete

3. Seleccione el paquete y haga clic en el botón de Eliminar